【Rメモ】インストールしてあるパッケージ一覧

新しくR環境を用意するときのために、自分のmacのRに入れてあるパッケージ一覧を載せておきます。正直全部を常に使っているわけではない(し、何で入れたのか覚えていないものもある)ですが、とりあえず新しくRを入れたときはこれらを全部実行しようと思います。

 

プロキシの設定をしないといけない場合

プロキシ」と書かれているところに(多分)プロキシサーバーのアドレス、およびポート番号(と呼ばれるもの)を書きましょう。

# Setting Codes
#options(RCurlOptions = list(proxy = "proxy.プロキシ"))
options( CRAN = "http://cran.ism.ac.jp:8080" )
Sys.setenv( "http_proxy" = "proxy.プロキシ" )
Sys.setenv( "https_proxy" = "proxy.プロキシ" )

 

パッケージをインストールする

# ggplot2(グラフ描くやつ)、
# dplyr(データフレームを操作するやつ)、
# tidyr(tidyなdataを作るやつ)、
# readr(データファイルを読み込むやつ)、
# purrr(listやvectorを操作するやつ)、
# tibble(tidyverseで使うデータフレーム的な)、
# stringr(文字列を操作するやつ)、
# forcats(ファクタ・因子を操作するやつ)
# をまとめたパッケージ集
install.packages("tidyverse")

# 小さいデータセットのコレクション
# 統計の歴史、可視化の歴史にとって重要で面白いもの
install.packages("HistData")

# 「Graphical Data Analysis with R」という本で使われているデータセット
install.packages("GDAdata")

# Visualizing Categorical Data
# 「Discrete Data Analysis with R」という本のサポートパッケージ
# データが色々入っている
install.packages("vcd")

# 『Modern Applied Statistics with S』に出てくるデータセットと関数
install.packages("MASS")

# 回帰に関連する関数やデータを集めたやつ
# 分散分析もできる
# ボックスコックス変換もできるらしい
install.packages("car")

# 地理情報を扱うためのやつ
install.packages("sp")

# 点が六角形の散布図みたいなのを作れるやつ
# ドット絵みたい
install.packages("hexbin")

# グラフをきれいに作れるやつ
# 軸や凡例の区切りやラベルを自動的に決定できる
# カラーパレットを作れる
install.packages("scales")

# ggplotの体裁を整えるやつ
install.packages("ggthemes")
install.packages("gridExtra")

# バイオリンプロットを描くやつ
# バイオリンプロットを補助プロットとして追加できる
# 色々カスタマイズできる
install.packages("vioplot")

# ペアプロット(散布図行列)を作るやつ
install.packages("GGally")

# 三次元的なプロットを描けるやつ
install.packages("rgl")
# GoogleにデータをアップしなくてもGoogleチャートを作る
# ウェブに埋め込める
install.packages("googleVis")

# 心理学のためのやつ
# 記述統計、因子分析に便利な関数が入ってる
install.packages("psych")

# rstan(ベイズ)関連のやつ
install.packages("rstan", repos = "https://cloud.r-project.org/", dependencies=TRUE)
install.packages("ggmcmc")

# R Markdownのためのやつ
install.packages("rmarkdown")
install.packages("knitr")
install.packages("caTools")
install.packages("rmdformats")
install.packages("rticles")
install.packages("tufte")

# diffusion modelに使うやつinstall.packages("rtdists")
install.packages("hBayesDM")

# 反応時間の処理に使うやつ
install.packages("trimr")

# 画像処理に使うやつ
install.packages("imager")
install.packages("sketcher")

# パイプ演算子%>%が使えるようになるやつ
install.packages("magrittr")

# 線形混合モデルを使うやつ
install.packages("lmerTest")
install.packages("phia")

# GitHub上にあるパッケージをインストールできるようになるやつ
install.packages("devtools")
devtools::install_github("crsh/papaja") 
devtools::install_github("yihui/xaringan")

# 乱数を取得するやつ
install.packages("random")

# サンプルサイズの計算に使うやつ
install.packages("pwr")

# .xlsxファイルを扱うやつ
install.packages("openxlsx")

# Rで数値計算した結果をTexにまとめるやつ
install.packages("Hmisc")

HistData」に入っているデータ一覧はこちら

GDAdata」に入っているデータ一覧はこちら

vcd」に入っているデータ一覧はこちら

MASS」に入っているデータ一覧はこちら