新しくR環境を用意するときのために、自分のmacのRに入れてあるパッケージ一覧を載せておきます。正直全部を常に使っているわけではない(し、何で入れたのか覚えていないものもある)ですが、とりあえず新しくRを入れたときはこれらを全部実行しようと思います。
プロキシの設定をしないといけない場合
「プロキシ
」と書かれているところに(多分)プロキシサーバーのアドレス、およびポート番号(と呼ばれるもの)を書きましょう。
# Setting Codes
#options(RCurlOptions = list(proxy = "proxy.プロキシ"))
options( CRAN = "http://cran.ism.ac.jp:8080" )
Sys.setenv( "http_proxy" = "proxy.プロキシ" )
Sys.setenv( "https_proxy" = "proxy.プロキシ" )
パッケージをインストールする
# ggplot2(グラフ描くやつ)、 # dplyr(データフレームを操作するやつ)、 # tidyr(tidyなdataを作るやつ)、 # readr(データファイルを読み込むやつ)、 # purrr(listやvectorを操作するやつ)、 # tibble(tidyverseで使うデータフレーム的な)、 # stringr(文字列を操作するやつ)、 # forcats(ファクタ・因子を操作するやつ) # をまとめたパッケージ集 install.packages("tidyverse") # 小さいデータセットのコレクション # 統計の歴史、可視化の歴史にとって重要で面白いもの install.packages("HistData") # 「Graphical Data Analysis with R」という本で使われているデータセット install.packages("GDAdata") # Visualizing Categorical Data # 「Discrete Data Analysis with R」という本のサポートパッケージ # データが色々入っている install.packages("vcd") # 『Modern Applied Statistics with S』に出てくるデータセットと関数 install.packages("MASS") # 回帰に関連する関数やデータを集めたやつ # 分散分析もできる # ボックスコックス変換もできるらしい install.packages("car") # 地理情報を扱うためのやつ install.packages("sp") # 点が六角形の散布図みたいなのを作れるやつ # ドット絵みたい install.packages("hexbin") # グラフをきれいに作れるやつ # 軸や凡例の区切りやラベルを自動的に決定できる # カラーパレットを作れる install.packages("scales") # ggplotの体裁を整えるやつ install.packages("ggthemes") install.packages("gridExtra") # バイオリンプロットを描くやつ # バイオリンプロットを補助プロットとして追加できる # 色々カスタマイズできる install.packages("vioplot") # ペアプロット(散布図行列)を作るやつ install.packages("GGally") # 三次元的なプロットを描けるやつ install.packages("rgl") # GoogleにデータをアップしなくてもGoogleチャートを作る # ウェブに埋め込める install.packages("googleVis") # 心理学のためのやつ # 記述統計、因子分析に便利な関数が入ってる install.packages("psych") # rstan(ベイズ)関連のやつ install.packages("rstan", repos = "https://cloud.r-project.org/", dependencies=TRUE) install.packages("ggmcmc") # R Markdownのためのやつ install.packages("rmarkdown") install.packages("knitr") install.packages("caTools") install.packages("rmdformats") install.packages("rticles") install.packages("tufte") # diffusion modelに使うやつ
install.packages("rtdists") install.packages("hBayesDM") # 反応時間の処理に使うやつ install.packages("trimr") # 画像処理に使うやつ install.packages("imager") install.packages("sketcher") # パイプ演算子%>%が使えるようになるやつ install.packages("magrittr") # 線形混合モデルを使うやつ install.packages("lmerTest") install.packages("phia") # GitHub上にあるパッケージをインストールできるようになるやつ install.packages("devtools") devtools::install_github("crsh/papaja") devtools::install_github("yihui/xaringan") # 乱数を取得するやつ install.packages("random") # サンプルサイズの計算に使うやつ install.packages("pwr") # .xlsxファイルを扱うやつ install.packages("openxlsx") # Rで数値計算した結果をTexにまとめるやつ install.packages("Hmisc")
「HistData
」に入っているデータ一覧はこちら。
「GDAdata
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「vcd
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「MASS
」に入っているデータ一覧はこちら。